潔凈室一般采用封閉式結構，將一定空間范圍內的微粒子、細菌等污染物排除，并將室內溫度、潔凈度、室內壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電控制在某一需求范圍內。控制潔凈室的潔凈空氣一方面需要不斷地給潔凈室內傳輸干凈空氣，另一方面要加速高濃度污染空氣的排放，潔凈室內維持一定的正壓是保障不受或少受污染、以維持潔凈度等級必不可少地條件之一。

為了確保潔凈房間內所需的空氣的清潔度，可以采取多種綜合措施來實現，簡單概括如下：

一、源頭把控，控制污染源減少污染量

盡可能的選擇污染小的技術和設備，或采取必要的隔離和負壓措施，人員進入應著無塵服，戴無塵帽等，且經過風淋吹淋，減少人員所攜帶的污染物，貨物進出也應在貨淋室吹淋后方可進入無塵室。

二、有效過濾，防止室外污染侵入房間

按潔凈度需求配備相應數量的FFU風機過濾器，確保換氣次數達標，潔凈等級越高，通風次數越多。對于室內正壓控制，工業潔凈室和一般生物潔凈室均采用正壓措施。

三、布局合理，有效消除室內污染顆粒

根據潔凈室面積大小，搭建方位，設計送回風口的位置、大小和形式，使室內氣流向一定方向流動，防止死角和二次污染。在每日操作結束后，操作人員應做好工作臺面，地面，凳子的清潔工作。